Karlstein an der Thaya ist eine Marktgemeinde mit rund 1.800 Einwohnern im Bezirk Waidhofen an der Thaya in Niederösterreich.
Auf einer Fläche von 48,86 km² umfasst das Gemeindegebiet elf Dörfer und den Markt Karlstein. Die Landschaft ist geprägt von Äckern, Wiesen und bewaldeten Höhen des milderen und sanfteren nordöstlichen Waldviertels, zwischen denen sich die Deutsche Thaya ein enges Tal mit steilen Granitfelsen gegraben hat.
Katastralgemeinden sind Eggersdorf, Göpfritzschlag, Goschenreith, Griesbach, Hohenwarth, Karlstein an der Thaya, Münchreith an der Thaya, Obergrünbach, Schlader (inkl. Wertenau), Thuma, Thures.
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